Desain dan Evaluasi Vaksin Multi-Epitope dari Protein HMGA1 dengan Target Triple-Negative Breast Cancer: Pendekatan Imunoinformatika

Triple-Negative Breast Cancer (TNBC) adalah kanker payudara yang ditentukan oleh ketidakhadirannya ekspresi reseptor HER2, estrogen, dan progesteron. Vaksin kanker dalam bidang imunoterapi menjadi pilihan pengobatan yang menjanjikan untuk pengobatan TNBC dengan metastasis tinggi. Penelitian ini bertujuan untuk mengembangkan vaksinasi baru berbasis peptida multi-epitop terhaadap TNBC menggunakan protein HMGA1 (High Mobility Group AT-hook 1) yang memiliki ekspresi berlebih pada TNBC. Agonis TLR4 (Toll-like receptor 4) rekombinan digunakan sebagai bahan pembantu untuk merangsang respons imun. Setelah pemilihan sekuens yang didapatkan dari epitop Sel T dan Sel B, dilakukan desain kandidat vaksin dengan menggabungkan penghubung yang sesuai. Untuk mencapai model 3D yang paling baik, model 3D yang diprediksi perlu disempurnakan dan divalidasi. Selain itu, untuk menunjukkan kompleks vaksin stabil, dilakukan analisis docking dan simulasi molekuler dinamis. Evaluasi kelarutan dan sifat fisikokimia dari kandidat vaksin TNBC mempunyai kelarutan 0.927035, jumlah asam amino 198, berat molekul 21016.19 g/mol, pI teoritis 10.90, jumlah residu bermuatan negatif 10, jumlah residu bermuatan positif 53, jumlah total atom 3003, koefisien kepunahan 7540 m2 / mol, indeks kestabilan 50.3, indeks alifatik 35.66, dan rata-rata hidrofobisitas -1.322. Hasil analisis homolog kandidat vaksin dari protein HMGA1 menyatakan bahwa residu asam amino penyusun peptida tidak bersifat homolog sehingga diprediksi tidak menimbulkan respons autoimun.