ANALISIS SEL T & SEL B PADA 3-Chymotrypsin-Like Proteinase SARS-COV-2 SEBAGAI KANDIDAT VAKSIN COVID-19: PENDEKATAN IMUNOINFORMATIKA

Salah satu langkah paling efektif dalam menangani pandemic COVID-19 yaitu melaluivaksinasi. Berbagai jenis vaksin yang digunakan masih banyak menimbulkan efeksamping. Vaksin subunit memiliki keunggulan yaitu hanya menggunakan komponenantigenik dengan penambahan adjuvant dan penghubung. 3-Chymotrypsin-LikeProteinase pada SARS-CoV-2 bertanggung jawab dalam replikasi dan transkripsivirus yang diprediksi memiliki antigenisitas dan berpotensi dijadikan sebagai antigendalam pengembangan vaksin COVID-19. Penelitian ini bertujuan untuk menentukanurutan epitop dan posisi yang berpotensi sebagai kandidat vaksin COVID-19 melaluipendekatan imunoinformatika. Epitop Sel T Sitotoksik, Sel T Penolong dan Sel Bdiprediksi menggunakan situs web Vaxijen 2.0, AllerTOP, ToxinPred, NCBI BLAST,ExPasy ProtParam. Seluruh epitop terpilih digabungkan menggunakan linker danpenambahan adjuvant untuk membentuk desain vaksin multi-epitop. Hasil desainprotein vaksin dilakukan prediksi struktur sekunder menggunakan PSIPRED danpemodelan struktur 3D menggunakan GalaxyRefine dan dilakukan analisis molekulardocking pada TLR3 dengan protein vaksin melalui YASARA dan melihat interaksimenggunakan LigPLot. Desain vaksin multi-epitop terdiri dari 2 epitop sel T sitotoksikQTFSVLACY dan GSVGFNIDY, 2 epitop sel T penolong KSNHNFLVQAGNVQLdan SNHNFLVQAGNVQLR, serta 2 sel B EDMLNPNYEDL danTANPKTPKYKFVRIQPG. Hasil analisis molekular docking menunjukkan bahwaadanya interaksi antara protein vaksin dengan TLR3 yang ditunjukkan dengan adanyaikatan hidrogen