Molecular Docking Senyawa Caboxamycin Pada Mycobacterium Tuberculosis Polyketide Synthase 13 (Pks13)

Senyawa caboxamycin merupakan antibiotik baru yang termasuk dalam kelompok benzoxazole yang diproduksi dari Streptomyces sp. NTK 937 (marine strain). Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui mekanisme penghambatan senyawa caboxamycin terhadap Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13) secara in silico dengan metode molecular docking. Tahapan Molecular docking dimulai dengan optimasi struktur senyawa caboxamycin 3D, preparasi protein polyketide synthase 13 (Pks13), validasi metode, dan docking senyawa caboxamycin yang teroptimasi pada protein Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13). Hasil docking protein Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13) pada ligan standard adalah -144,0 kkal/mol, pada streptomisin adalah -101,7 kkal/mol, dan pada caboxamycin adalah -75,9 kkal/mol..Streptomisin dan caboxamycin memiliki ikatan hidrogen yang sama terhadap residu asam amino protein Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13) yaitu ASN-1640 dan HIS-1664, sehingga caboxamycin memiliki mekanisme kerja dalam menghambat polyketide synthase 13 (Pks13) pada Mycobacterium tuberculosis secara in silico. Senyawa caboxamycin memiliki mekanisme molekuler dalam menghambat protein Mycobacterium tuberculosis polyketide synthase 13 (Pks13) yang ditunjukkan dengan adanya pembentukkan ikatan hidrogen. Sehingga senyawa caboxamycin berpotensi sebagai antituberkulosis secara in silico.