Analisis In Silico Senyawa Dalam Berbagai Varietas Beras (Oryza Sativa L.) Pada Reseptor Antioksidan Dengan Metode Docking

Varietas beras memiliki potensi sebagai antioksidan dengan penangkapan radikal bebas. Penelitian ini bertujuan mendapatkan kandidat senyawa dalam varietas beras yang memiliki afinitas antioksidan dengan molekuler docking dan menganalisis selektivitas senyawa varietas beras dengan protein target (5FIW, 5YTO, 2F8A). Hasil penelitian menyatakan senyawa pada varietas beras dapat memiliki potensi sebagai antioksidan dalam tubuh, untuk membuktikan hal tersebut, sebagai langkah awal dapat dilakukan dengan kimia komputasi menggunakan molecular docking. Software yang digunakan untuk molecular docking adalah YASARA, MarvinSketch, PLANTS dan VMD. Penelitian ini menggunakan tiga macam senyawa pembanding, yaitu vitamin C, vitamin E dan kursetin. Protein target yang sudah tervalidasi berjumlah 3 reseptor dengan kode PDB 5FIW (Myeloperoksidase), 5YTO (Superoxide Dismutase dan 2F8A (Glutathion peroxidase). Berdasarkan penelitian ini telah diperoleh senyawa yang aktif terhadap masing-masing reseptor dan pembanding, yaitu Tokotrienol dan Oryzanol pada reseptor dengan kode PDB 5FIW. Proantosianidin, Tokotrienol dan Oryzanol pada reseptor dengan kode PDB 5YTO. Tokotrienol pada reseptor dengan kode PDB 2F8A dengan pembanding vitamin E.